Bacteria isolated from endotracheal aspirate samples and antibiotic resistance rates: 5-year analysis: 5-year retrospective analysis

Abstract

Objective: Ventilator-associated pneumonia (VAP) is a significant nosocomial infection occurring in patients treated in intensive care units (ICU). This study aimed to determine the antimicrobial resistance rates in microorganisms isolated from endotracheal aspirate (ETA) samples and evaluate the changes in 5 years. Material and Methods: ETA specimens sent to our laboratory from the ICU between 2016-2020 were evaluated retrospectively. Bacterial identification and antimicrobial sensitivity tests were made using conventional methods and automated systems. Results: A total of 3,943 ETA specimens examined during the study period were evaluated. Significant bacteriological growth was detected in 46.4%, and these were included in the study. Growth of Gram-negative bacteria was observed in 94.5%, and Gram-positive bacteria were found in 5.5%. The most frequently isolated organism was Acinetobacter baumannii, followed by Pseudomonas aeruginosa. A. baumannii was found as the agent having the highest rates of resistance in our study. The resistance rates were generally below 40% in P. aeruginosa strains, and Staphylococcus aureus' resistance rates were below 25%, except for penicillin and methicillin. Resistance against many antimicrobials was observed in Escherichia coli, and Klebsiella pneumoniae strains with a rate above 50%. In addition, resistance rates have been found to vary over the years. Conclusion: VAP is a frequently encountered infection in ICU, generally caused by resistant microorganisms. Treatment with antibiotics that are effective against causative agents as soon as possible is essential in decreasing mortality. Thus, antimicrobial resistance patterns should be followed up regularly, and treatment protocols should be updated according to this. © 2021 by Türkiye Klinikleri.

Amaç: Yoğun bakım ünitelerinde (YBÜ) tedavi edilen hastalarda, ventilatörle ilişkili pnömoni [ventilator-associated pneumonia (VAP)] önemli bir hastane enfeksiyonudur. Bu çalışmanın amacı, YBÜ’de yatan hastaların endotrakeal aspirat (ETA) örneklerinden izole edilen mikroorganizmaların, antimikrobiyal direnç oranlarını belirlemek ve 5 yıl içindeki değişimini değerlendirmektir. Gereç ve Yöntemler: 2016 ve 2020 yılları arasında YBÜ’den laboratuvarımıza gönderilen ETA örnekleri retrospektif olarak incelenmiştir. Bakteri tanımlaması ve antibiyotik duyarlılık testleri, konvansiyonel yöntemler ve otomatize sistemler kullanılarak yapılmıştır. Bulgular: Çalışma süresince 3.943 ETA örneği değerlendirilmiş, %46,4’ünde bakteriyolojik açıdan anlamlı üreme tespit edilmiş ve çalışmaya dâhil edilmiştir. Bunların %94,5’inde Gram-negatif bakteri; %5,5’inde ise Gram-pozitif bakteri ürediği saptanmıştır. En sık Acinetobacter baumannii, 2. sırada Pseudomonas aeruginosa izole edilmiştir. Çalışmamızda, A. baumannii en yüksek direnç oranlarına sahip etken olarak saptanmıştır. P. aeruginosa suşlarında direnç oranlarının genel olarak %40’ın, Staphylococcus aureus’da penisilin ve metisilin hariç %25’in altında olduğu belirlenmiştir. Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarında ise birçok antimikrobiyale %50’nin üzerinde direnç gözlenmiştir. Ayrıca direnç oranlarının yıllar içinde değişkenlik gösterdiği görülmüştür. Sonuç: VAP, YBÜ’de sık karşılaşılan, genellikle de dirençli mikroorganizmaların etken olduğu bir enfeksiyondur. Etkene uygun antibiyotiğin bir an önce başlanması mortalitenin azaltılması açısından oldukça önemlidir. Bu nedenle, antimikrobiyal direnç paternleri düzenli olarak izlenmeli ve buna göre tedavi protokolleri güncellenmelidir.