Gelişmiş Arama

Basit öğe kaydını göster

dc.contributor.advisorKöçkar, Feray
dc.contributor.authorSav, Feyza Nur
dc.date.accessioned2023-09-11T07:06:06Z
dc.date.available2023-09-11T07:06:06Z
dc.date.issued2023en_US
dc.date.submitted2023
dc.identifier.citationSav, Feyza Nur. Kolon kanser modelinde TGF-β1'İN ADAMTS8 gen ekspresyonuna etkilerinin belirlenmesi. Yayınlanmamış yüksek lisans tezi. Balıkesir Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, 2023.en_US
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12462/13339
dc.descriptionBalıkesir Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalıen_US
dc.description.abstractADAMTS-8, ADAMTS (A Disintegrin-like And Metalloproteinase with Thrombospondin Motifs) adı verilen hücreler arası matriks proteaz ailesinin bir üyesidir. ADAMTS-1 ve ADAMTS-8, Vasküler Endotelyal Büyüme Faktörü (VEGF) ve Fibroblast Büyüme Faktörü 2 (FGF-2) tarafından uyarılan, yeni damar oluşumunu engelleyen güçlü anjiyoinhibitörlerdir. TGF-β sitokini tümör oluşumunun erken fazında, tümör baskılayıcı fonksiyonlara sahipken, tümörün geç evresinde tümörün ilerlemesi ve metastazına öncülük ettiği bilinmektedir. ADAMTS-8’in TGF-β sitümülasyonuyla, kolorektal kanserdeki işlevini ortaya koyan herhangi bir çalışmaya rastlanmamıştır. Bu tez çalışması, kolorektal kanser modeli (SW480) üzerinde TGF-β'nın ADAMTS-8'in transkripsiyonel regülasyonuna katkısının belirlenmesini amaçlamaktadır. Bu tez çalışmasının sonucunda, TGF-β'nın 20 ng/mL'lik dozda SW480 kolon kanseri hücrelerinde proliferatif etkiye sahip olduğu MTT testi ile belirlenmiştir. Ardından, TGF-β sitokinin farklı zaman aralıklarında ADAMTS-8’in mRNA ve protein düzeyinde ifadesinde artışa sebep olduğu Real Time PCR ve Western Blot çalışmalarıyla belirlenmiştir. TGF-β aracılı, ADAMTS-8 promotorunun transkripsiyonel aktivitesi beş farklı uzunlukta promotor parçasının SW480 hücrelerine geçici transfeksiyonu ile araştırılmıştır. Transfeksiyon sonucunda en aktif promotor parçalarının pMet_TS-8[-223/+323], pMet_TS-8[-662/+323] ve pMet_TS-8[-851/+323] olduğu tespit edilmiştir. Yolak inhibisyon çalışmaları sonucunda, TGF-β ile uyarılan ADAMTS-8 regülasyonunun mRNA ve protein düzeyinde p38 MAPK, MEK, JNK, PI3K ve SMAD-3 hücre içi sinyal yolları üzerinden olduğu belirlenmiştir. Ayrıca, transkripsiyonel aktivitedeki artışın p38 MAPK, MEK, JNK, PI3K ve SMAD-3 yolları üzerinden düzenlendiği transfeksiyon çalışması ile belirlenmiştir. SW480 hücrelerinde TGF-β uygulamasıyla birlikte, SMAD2/3 transkripsiyon faktörünün ADAMTS-8 promotorundaki bazı bölgelere fonksiyonel olarak bağlandığı kromatin immünopresipitasyonu (ChIP) analiziyle doğrulanmıştır.en_US
dc.description.abstractADAMTS-8 is a member of the family of intercellular matrix proteases called ADAMTS (A Disintegrin-like And Metalloproteinase with Thrombospondin Motifs). ADAMTS-1 and ADAMTS-8 are potent angioinhibitors that inhibit new vessel formation induced by vascular endothelial growth factor (VEGF) and fibroblast growth factor-2 (FGF-2). While TGF-β cytokine has tumor suppressor functions in the early phase of tumorigenesis, it is known to lead to tumor progression and metastasis in the late phase of the tumor. No study has been found that demonstrates the function of ADAMTS-8 in colorectal cancer with TGF-β stimulation. This thesis study aims to determine the contribution of TGF-β to the transcriptional regulation of ADAMTS-8 in a colorectal cancer model (SW480). As a result of this thesis, it was determined by the MTT test that TGF-β had a proliferative effect at a dose of 20 ng/mL on SW480 cells. Then, it was determined by Real Time PCR and Western Blot studies that TGF-β cytokine caused an increase in the expression of ADAMTS-8 at mRNA and protein levels at different time intervals. TGF-β-mediated transcriptional activity of the ADAMTS-8 promoter was investigated by transient- transfection of five different lengths of promoter fragments into SW480 cells. As a result of transfection, it was determined that the most active promoter parts were pMet_TS-8[-223/+323], pMet_TS-8[-662/+323] and pMet_TS-8[-851/+323]. As a result of pathway inhibition studies, it was determined that the regulation of ADAMTS-8 induced by TGF-β was via p38 MAPK, MEK, JNK, PI3K and SMAD-3 intracellular signaling pathways at the mRNA and protein level. It was determined by transfection study that the increase in transcriptional activity was regulated via p38 MAPK, MEK, JNK, PI3K and SMAD-3 pathways. With administration of TGF-β in SW480 cells, the functional binding of the SMAD2/3 transcription factor to certain regions in the ADAMTS-8 promoter was confirmed by Chromatin Immunoprecipitation Assay (ChIP) analysis.en_US
dc.language.isoturen_US
dc.publisherBalıkesir Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsüen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectADAMTSen_US
dc.subjectADAMTS-8en_US
dc.subjectTGF-βen_US
dc.subjectSW480en_US
dc.subjectKolorektal Kanseren_US
dc.subjectColorectal Canceren_US
dc.titleKolon kanser modelinde TGF-β1'İN ADAMTS8 gen ekspresyonuna etkilerinin belirlenmesien_US
dc.title.alternativeDetermination of the effects of TGF-β1 on ADAMTS8 gene expression in a colon cancer modelen_US
dc.typemasterThesisen_US
dc.contributor.departmentFen Bilimleri Enstitüsüen_US
dc.relation.tubitak122Z754
dc.relation.tubitak2210-C
dc.relation.publicationcategoryTezen_US


Bu öğenin dosyaları:

Thumbnail

Bu öğe aşağıdaki koleksiyon(lar)da görünmektedir.

Basit öğe kaydını göster