Marmara Bölgesinde yetiştirilen bazı zeytin (Olea europaea L.) kültivarlarının moleküler sistematik analizi

Abstract

Yapılan incelemeler sonucu PCR (Polymerase Chain Reaction)'a dayalı DNA markırların günümüzde ön plana çıkmış oldukları, bunlardan da RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) polimorfizm belirleme yaklaşımının bugün en çok kullanılan yöntemler arasında yer aldığını görüldü. RAPD markırlar taksonomik sınıflandırmada, sistematik ilişkilerin belirlenmesinde ve populasyon genetiği çalışmalarında, kullanılabilmektedir Bu çalışmada, Marmara Bölgesinde yetiştirilen bazı zeytin (Olea europaea L.) kültivarlarının DNA markırları kullanılarak moleküler sistematiğinin yapılması hedeflenmiştir. Bu amaçla, RAPD-PCR tekniği kullanılarak kültivarlar arasında genetik benzerlik ya da farklılıkların belirlenmesine çalışılmıştır. RAPD-PCR sonuçlarına göre; kullanılan 10 baz uzunluğunda 7 farklı primer amplifikasyon göstermiş ve çalışılan 12 kültivar arasında % 46,42 oranında polimorfizm elde edilmiştir. Primerlerden toplam 84 karakter elde edilmiş ve bu karakterlerin 39 tanesi polimorfik bulunmuştur. PAUP* (Phylogenetic Analysis Using Parsimony and Other Methods) filogenetik analiz programı kullanılarak kültivarlar arasındaki akrabalık ilişkileri ve genetik uzaklıkları belirlenmiştir. PAUP verilerine göre birbirine en yakın genetik uzaklık 0,03571 ile Gordal ve Karamürsel su kültivarları arasında iken, en uzak genetik uzaklık 0,17857 ile Arbequina ile Ascolana, Manzanilla hermandos, Gemlik, Verdial ve Vegral kültivarları arasında tespit edilmiştir.

Based on our literature research, it is noticed that DNA markers based on PCR (Polymerase Chain Reaction) techniques are widely used in recent days. Depending on our observation, RAPD (Randomly Amplified Polymorphic DNA) was found one of the most commonly used applications for determining the polymorphisms. RAPD markers can be used in population genetics studies, in systematic analyses, and in taxonomic classification studies. In this research, it is intended to perform a molecular systematic analysis using DNA markers for some olive cultivars (Olea europaea L.) grown in the Marmara Region. Thus using RAPD-PCR techniques, it was attempted to determine the genetic relationships, including similarities and differences, among the ingroup taxa. Based on the RAPD-PCR techniques; seven different primers with 10 base-pair long sequence showed amplification and 46.42 % polymorphism was found between the studied 12 cultivars. 84 characters were derived from the primers in total and 39 of these were found to be polymorphic. Relationships and genetic distances between the cultivars were calculated by using the PAUP* (Phylogenetic Analysis Using Parsimony and Other Methods phylogenetic) analysis program. Based on the PAUP analyses, the closest genetic distance was found between Gordal and Karamursel su cultivars as 0.03571 whereas the most distant values were found between Arbequina and, respectively, Ascolana, Manzanilla hermandos, Gemlik, Verdial, and Vegral cultivars.