Kiraz ve uslu zeytin çeşitlerinde pedisele has genlerin tespiti

Abstract

Bu çalışmada zeytinde (Olea europaea L.) Uslu (Meyvesi kolay dökülen) ve Kiraz (Meyvesi zor dökülen) çeşitlerinin meyve pedisellerinden cDNA kütüphaneleri oluşturuldu. Her iki kütüphaneden rastgele toplam 400 koloni seçilerek taşıdıkları insertlerin biyoinformatik analizi yapıldı. Biyoinformatik analizler sonucunda başka bitkilerden rapor edilmiş 19 farklı cDNA elde edildi. Bu 19 cDNA molekülünden 14'ünün daha zeytinde bulunmamış olduğu tespit edildi. Ayrıca 9 cDNA'nın muhtemelen açık okuma çerçevesi içerdikleri fakat erişimi olan veritabanlarında benzerlerinin bulunmadığı tespit edildi. Bu cDNA'lardan 14'ü EST veritabanında zeytinle homoloji göstermedi. Dolayısıyla bu cDNA'lar zeytinden ilk defa elde edilmiş oldu. Sonuçların genel analizi elde edilen cDNA moleküllerinin çoğunlukla zeytin pediseline özgü olabileceğini düşündürmektedir. Uslu pedisel kütüphanesinde bulunan meyve dökülmesinde rol oynayan ACC sentazın ekspresyon seviyesi Kiraz pediselindekinden yaklaşık 5 kat fazla ölçüldü. Bunun gibi farklılık gösteren cDNA moleküllerinin, iki çeşit arasındaki dökülme farkını açıklama potansiyeli taşıdıkları söylenebilir.

In this study, cDNA libraries from Uslu (firm fruit holder) and Kiraz (loose fruit holder) olive (Olea europaea L.) cultivars were constructed for capturing and analysis of differentially expressed cDNAs, using randomly picked 400 colonies in total from both libraries. Of all the cDNAs analysed, 19 were found to be unique genes through bioinformatic analyses. Of these 19 cDNAs, 14 were not reported from olive before and hence were detected for the first time with this study. Nine cDNA were found to harbor one or more open reading frames but not to have any similarity in any record from the public databases. Most of the cDNAs obtained from these libraries appeared to be pedicel specific if not cultivar - pedicel specific. The expression level of ACC synthase acting in fruit abscission found 5 fold more "Uslu" cDNA library than that of "`Kiraz" Similarly differantiating cDNAs suggest a potential to explain the abscission difference between two cultivars.