Gelişmiş Arama

Basit öğe kaydını göster

dc.contributor.authorTürkoğlu, Sümeyye Aydoğan
dc.contributor.authorGüler, Gizem
dc.contributor.authorKöçkar, Feray
dc.date.accessioned2019-05-16T19:32:05Z
dc.date.available2019-05-16T19:32:05Z
dc.date.issued2018
dc.identifier.issn1303-5002
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12462/3527
dc.descriptionTürkoğlu, Sümeyye Aydoğan (Balikesir Author)en_US
dc.description.abstract26S proteasome non-ATPase subunit 4 (PSMD4) that has a molecular weight of 41 kDa is included on chromosome 1 (1q21.3). PSMD4 protein is a subunit of the 19S regulatory region in the 26S proteasome. The proteasome breaks down proteins that are not needed or non-functional in the cell. We have limited data about the regulation of this gene in the literature. In our research, changes in the mRNA and protein levels of the PSMD4 gene were investigated in different cancer cell lines (prostate, breast, colon, cervix, hepatoma, osteosarcoma and pancreas) and a normal cell (human vein endothelial cell). The highest expression of PSMD4 gene was seen in HUVEC and PC-3 cells. Bioinformatic analysis was also performed on PSMD4 protein for different species namely human, mouse and rat. Our Bioinformatic analyses showed that first 250 nucleotides are much conserved in all three species.en_US
dc.description.abstract26S proteazom non ATPaz subunit 4 (PSMD4) kromozom 1’in q kolunun 21.3 bölgesinde lokalize olmuştur ve 41 Kda moleküler ağırlığında protein kodlamaktadır. PSMD4, 26S proteazomun yapı birimi olan 19S düzenleyici yapı biriminde görev yapmaktadır. Proteozomun ana görevi ihtiyaç duyulmayan işlevini yitirmiş ya da zarar görmüş proteinlerin yıkımıdır. Literatürde çok işlevli protein olan PSMD4 ve onun regülasyonu hakkındaki bilgiler oldukça sınırlıdır. Bu çalışmada; PSMD4’ün mRNA ve protein seviyesindeki ekspresyonu çok sayıda kanser hücre hattında (prostat, meme, kolon, servik, hepotoma, kemik ve pankreas kanseri) ve bir normal hücrede (Göbek kordonu epitel hücresi) incelenmiştir. PSMD4 mRNA ve protein seviyesindeki ekspresyonu PC-3 ve HUVEC hücre hatlarında en yüksek seviyede elde edilmiştir. Ayrıca PSMD4 proteinin insan, fare ve tavşan gibi farklı türlerdeki biyoinformatik analizleri 3 türde ilk 250 amino asit benzer olduğunu ve korunduğu göstermiştir.en_US
dc.language.isoengen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectMühendisliken_US
dc.subjectKimyaen_US
dc.subjectBiyolojien_US
dc.subjectKimyaen_US
dc.subjectOrtak Disiplinleren_US
dc.subjectPSMD4en_US
dc.subjectCanceren_US
dc.subjectCell Linesen_US
dc.subjectBioinformaticsen_US
dc.subjectPSMD4en_US
dc.subjectKanseren_US
dc.subjectHücre Hattıen_US
dc.subjectBiyoinformatiken_US
dc.titleThe bioinformatic and expression analysis of PSMD4 geneen_US
dc.title.alternativePSMD4 geninin ekspresyonu ve biyoinformatik analizien_US
dc.typearticleen_US
dc.relation.journalHacettepe Journal of Biology and Chemistryen_US
dc.contributor.departmentBalıkesir Üniversitesien_US
dc.identifier.volume46en_US
dc.identifier.issue3en_US
dc.identifier.startpage329en_US
dc.identifier.endpage336en_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US


Bu öğenin dosyaları:

Thumbnail

Bu öğe aşağıdaki koleksiyon(lar)da görünmektedir.

Basit öğe kaydını göster